Глава 207. Преимущество в моих руках •
В лаборатории две группы людей, окруженные кругом, одна слева и одна справа, одна шумная и одна тихая.
Люди справа молча секвенируют, относятся к этому серьезно и внимательно, и действуют систематически.
Здесь размещены два новых секвенатора Daxia Zhizao. Хотя принцип работы отличается от Illumina, это все еще технология секвенирования второго поколения, с которой все хорошо знакомы, поэтому работать с ней не очень сложно.
Сейчас они просто повторно тестируют образцы из генного банка на новых машинах, знакомятся с работой платформы, анализируют данные и сравнивают данные разных платформ.
Результаты секвенатора второго поколения появляются довольно долго, это занимает несколько дней, они проводят тесты и просто ждут результатов.
Но справа группа людей очень оживленная, люди стоят кругом и обсуждают.
На операционном столе внутри размещены три маленьких и изящных секвенатора размером с ладонь, и три сотрудника усердно работают над ними.
Рядом с тремя стоит вежливый Цзян Кай, он тоже был повышен в должности и стал руководителем генетической лаборатории.
В этот момент он широко улыбается, смотрит на три прибора с горящими глазами и распределяет задачи.
«Сегодня пришли новые игрушки, не волнуйтесь, все по очереди, у каждого есть шанс. Вы можете сначала выбрать последовательность генов, которую хотите протестировать, а затем зарегистрироваться там».
«Как все знают, секвенатор нанопор имеет характеристики небольшого размера, быстрого создания библиотеки и генерации данных в реальном времени. Одним из ключевых преимуществ по сравнению с существующими технологиями секвенирования является более длинная длина чтения, что имеет значительные преимущества в секвенировании генома человека и облегчает обнаружение более крупных структурных изменений в отдельном геноме».
«Чем интереснее вещи, тем больше мы должны оставлять их напоследок, от простого к сложному. Поэтому сегодня мы начнем с бактерий и вирусов, затем начнем тестировать мышей и, наконец, протестируем последовательности ДНК человека».
«Кто-то уже тестирует кишечную палочку, дрожжи и аденовирус, вам нужно придумать новые сорта, нельзя повторять тесты».
«После того, как каждый закончит тестирование, необходимо провести анализ данных, сравнить их с известными данными и представить отчет».
Толпа ликует, все полны энтузиазма.
Хуан Цинь взглянул на цели секвенирования других коллег, всевозможные, от бактерий, вирусов до ДНК животных и людей.
Он зарегистрировал свою ДНК, ему было очень интересно узнать о возможностях нанопоровой технологии для тестирования длинных последовательностей генома, его геном уже был протестирован, данные хорошо известны, и, естественно, это лучший контрольный образец.
Уильямс сделал такой же выбор, как и он.
После регистрации Хуан Цинь протиснулся к коллеге, который работал, и внимательно наблюдал.
Он увидел, как этот коллега осторожно поместил набор реагентов, содержащий кишечную палочку, в машину, подключил свой ноутбук и начал ждать результатов в реальном времени.
В основной части машины фермент раскручивает двойную спираль ДНК и пропускает одну из цепей через белковую пору. Уникальная форма каждого основания ДНК может вызывать уникальные электрические помехи, тем самым считывая последовательность.
Во всем процессе длинная цепь ДНК похожа на толпу людей, стоящих в очереди у турникета метро, и каждое основание похоже на пассажира, входящего в узкую нанопору, где раздается звук, мигает ток, подтверждается личность, а затем следующий продолжает проходить.
Вскоре данные считывания фрагментов ДНК в реальном времени отобразились в компьютерном программном обеспечении.
Оператор воскликнул, глядя: «Это невероятно, это действительно быстро и точно, и соответствие ранее протестированным данным достигает 98%. Хотя точность все еще немного ниже, фактическое использование не является проблемой».
Цзян Кай быстро вышел вперед, подошел к экрану компьютера, быстро просмотрел его и одобрительно кивнул.
«Эта штука действительно хороша, в будущем мы сможем секвенировать, когда захотим, и нам не нужно ждать, пока соберется определенное количество».
«Кишечная палочка, которую вы тестируете, является устойчивой к лекарствам, верно? Посмотрите сюда, в ее геноме много структурных вариаций, которые невозможно измерить с помощью данных секвенатора второго поколения, теперь это выглядит очень очевидным, что очень помогает нам в изучении ее механизма устойчивости к лекарствам».
«Эта технология обнаружения может реализовать вывод данных в реальном времени и анализ в реальном времени, что действительно подходит для быстрого обнаружения микроорганизмов».
Внезапно в лаборатории раздались бурные аплодисменты, сопровождаемые шепотом.
«Это прогресс отечественной технологии!»
«Я не ожидал, что отечественный секвенатор будет таким передовым».
«Я слышал об этой штуке только за границей, я не ожидал, что теперь она будет отечественной».
«Это слишком удобно, больше не нужно ждать несколько дней, чтобы получить результаты».
На лицах у всех было взволнованное выражение, и они продолжали обсуждать это, пока не вернулись в офис. Хуан Цинь тоже был потрясен, он посмотрел на ошеломленного Уильямса рядом с собой, и в его сердце необъяснимо вспыхнуло чувство удовлетворения.
«Большой Вэй, ты раньше пользовался секвенатором нанопор? Большая ли разница с этой машиной?»
Уильямс выглядел потрясенным, и из его рта постоянно вылетали восклицания: «Удивительно, невероятно, это на самом деле китайская машина, я раньше пользовался машиной Oxford Nanopore, это было несколько лет назад, машина была очень простой, и ее нельзя сравнивать с этой».
«Однако их новая машина очень миниатюрная, размером всего с шоколадный батончик, и ее производительность также значительно улучшена, она должна быть сопоставима с этой».
Хуан Цинь сдержанно кивнул и посмотрел на секвенатор Daxia Zhizao: «Похоже, у нас есть надежда обогнать четвертое поколение технологий секвенирования, я просто не знаю, сможет ли машина второго поколения сравниться с Illumina».
«Да», — взгляд Уильямса тоже переместился, и он немного обеспокоенно сказал: «Если секвенатор второго поколения не будет отличаться от Illumina, то Illumina будет в опасности. В глобальной области секвенирования произойдут большие изменения».
Три дня спустя результаты секвенирования Daxia Zhizao также были получены.
Цзян Кай посмотрел на аналитические данные в своей руке, нахмурился, но вскоре снова расслабился.
«По сравнению с Illumina, в основных лекарственных формах нет разницы в длине чтения, все они представляют собой фрагменты 50-150».
«Существует некоторая разница в качестве получаемых данных. Illumina более точна, достигая 99,9%, а Daxia Zhizao составляет от 97 до 99%, данные нестабильны, и, возможно, потребуется провести несколько тестов. Однако это изначально сращивание фрагментов генов, и это должно быть решено технически».
«В целом, точность протестированных данных в порядке, но если алгоритм можно оптимизировать, точность будет выше».
«Анализ данных немного отстает, разрыв с Illumina велик, и он не так удобен, как наше собственное программное обеспечение».
«Результаты тестирования можно использовать, но необходимо оптимизировать алгоритм и использовать наше собственное программное обеспечение для анализа данных».
Результаты анализа были быстро доложены и получили положительный ответ.
******Поздней ночью Уильямс ворочался и долго не мог заснуть.
Наконец, он встал и достал из чемодана под кроватью старый ноутбук.
После ряда конфиденциальных операций он отправил электронное письмо по адресу, который выглядел как бессмысленный код.
«Этот ход очень плох».
«После полной локализации Саньцин пострадаем мы».
Через пять минут сразу же пришел ответ.
«Следи за собой».
«Не учи меня, что делать, Саньцин — это всего лишь особый случай, второго не будет».
«Полная локализация не так проста».
«В целом, преимущество на моей стороне».
Уголки рта Уильямса дернулись, он потерял дар речи, и в его сердце вспыхнул безымянный огонь.
Слишком высокомерно!
Старики на другом берегу океана слишком долго просидели в офисе, и пространство, в котором они находятся, уже сложилось с реальностью.
Они не видят истинной силы Саньцин, в отличие от него, который находится внутри и очень хорошо знает, насколько ужасен Саньцин.
Ладно, ладно, он просто наемный работник.
Зачем так много беспокоиться, просто делай свое дело.
В конце концов, это тоже указание сверху.